A noter dans vos agendas : la prochaine (et dernière pour cette année) conférence :

Pour préparer les programmes de colle :
Pour les 853 :
Génomique structurale et fonctionnelle
Quelques questions pour vérifier vos connaissances.....
Attention : plusieurs réponses possibles pour certaines questions
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Question 1 |
A | Permet d’étudier la cinétique de renaturation de l’ADN |
B | Est obtenu grâce à des mesures de diffractométrie aux rayons X |
C | Permet d’affirmer que le génome de la levure (Yeast) est plus grand que celui d’E. coli |
D | Montre que le génome de la levure ne comporte qu’une seule molécule d’ADN |
E | Montre que l’essentiel du génome est constitué d’ADN non répété chez la levure |
Question 2 |
Les protéines histones :
A | Sont regroupées en centrosomes autour de l’ADN, formant la structure en collier de perles |
B | Contiennent de nombreux résidus chargés positivement comme la lysine et l’arginine |
C | Peuvent être méthylées et/ ou phosphorylées |
D | Existent chez tous les êtres vivants |
E | Existent sous 5 formes de molécules différentes |
Question 3 |
Dans un fibroblaste humain en métaphase, on dénombre :
A | 184 molécules d’ADN |
B | 92 molécules d’ADN |
C | 46molécules d’ADN |
D | 23 molécules d’ADN |
E | Aucune de ces réponses n’est correcte |
Explication pour la question 3:
Ne pas oublier l'ADN mitochondrial!
Question 4 |
Un transcrit primaire isolé dans le compartiment nucléaire possède la séquence suivante :
5’- AUGUAUUUACCG-3’
Le brin codant de ce transcrit primaire est :A | 5’- TACATAAATGGC-3’ |
B | 3’- TACATAAATGGC-5’ |
C | 5’- ATGTATTTACCG-3’ |
D | 3’- ATGTATTTACCG-5’ |
E | 3'- AUGUAUUUACCG-5’ |
Question 5 |
Dans l’opéron lactose d’Escherichia coli :
Le milieu de culture ne contient pas de glucose mais d’autres substrats carbonés qui n’interfèrent pas avec l’opéron lactose.
- La synthèse de la β galactosidase est gouvernée par un gène de structure G (encore appelé Lac Z) dont on connaît deux allèles : G+ fonctionnel, et G- qui dirige la synthèse d’une enzyme inactive.
- La synthèse d’une autre protéine, la perméase au lactose, est codée par un autre gène de structure P (ou Lac Y) dont on connaît deux formes alléliques : P+ qui est fonctionnel, et P- qui est inactif.
- Le gène opérateur O existe sous trois formes alléliques :
- Enfin, l’ensemble de l’opéron lactose est sous la dépendance d’un gène régulateur R (ou Lac I), dont l’allèle R+ est fonctionnel pour la production d’un répresseur, alors que l’allèle R- dirige la synthèse d’un produit inactif.

A | Les souches 1 et 4 synthétisent la β galactosidase en présence ou en absence de lactose dans le milieu |
B | La souche 3 synthétise la β galactosidase en présence ou en absence de lactose dans le milieu |
C | La souche 5 ne synthétise la β galactosidase que lorsque le lactose est présent dans le milieu |
D | En absence ou en présence de lactose dans le milieu, la souche 7 synthétise une β galactosidase inactive |
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TP mitose et génome
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Question 1 |
La digestion d'un plasmide par deux enzymes de restriction Eco RI et Bam HI donne le résultat suivant :
Quelles affirmations sont exactes?

Quelles affirmations sont exactes?
A | Le plasmide a une longueur de 14 Kb |
B | Il y a un site de restriction à Eco RI et deux sites à BamHI |
C | Il existe plusieurs sites de coupure pour les deux enzymes mais un des sites est commun aux deux |
D | Les fragments de restriction obtenus avec Eco RI possèdent au moins un site de coupure à Bam HI |
E | Les fragments de restriction obtenus avec BamHI possèdent au moins un site de restriction à EcoRI |
Explication pour la question 1:
Le plasmide étant circulaire le nombre de fragments obtenus pour chaque digestion seule correspond au nombre de sites de l'enzyme considérée.
Question 2 |
Sur cette photo prise en TP de coupes d'apex de racines d'ail (préparation à l'orcéine acétique)
Quelles affirmations sont exactes?

Quelles affirmations sont exactes?
A | Certaines cellules sont en interphase. |
B | On distingue au moins deux phases de mitose |
C | Certaine cellules sont en prophase |
D | certaines cellules sont en métaphase |
E | Certaines cellules sont en anaphase |
Explication pour la question 2:
On observe plusieurs prophases et une télophase à droite du pointeur.
Question 3 |
Voici une préparation de lames du commerce de cellules humaines en mitose (l'individu concerné est de sexe féminin).
Relevez les affirmations exactes :

Relevez les affirmations exactes :
A | Si tous les chromosomes de l'individu sont présents, il y a 23 paires de chromosomes identiques |
B | Si tous les chromosomes de l'individu sont présents, il y a 46 molécules d'ADN |
C | Si tous les chromosomes de l'individu sont présents, il y a 92 molécules d'ADN |
D | Cette observation est obtenue en bloquant la mitose en prophase |
E | Cette observation est obtenue en bloquant la mitose en métaphase |
Question 4 |
Sur cette image prise dans des cultures de fibroblastes humains (microscopie confocale et immunolocalisation), relevez les affirmations correctes.
Copyright : IGH - UMR9002 CNRS-UM © 2005

Copyright : IGH - UMR9002 CNRS-UM © 2005
A | On distingue des noyaux (en bleu) de cellules en interphase et une cellule en prophase |
B | On distingue des cellules (en bleu) et une matrice extracellulaire abondante (en vert) |
C | On ne distingue pas la membrane plasmique mais des chromosomes sont visibles |
D | Une des cellules est en anaphase |
E | Une des cellules est en métaphase |
Explication pour la question 4:
Il s'agit d'une vue polaire d'une métaphase.
Question 5 |
Sur cette préparation de cellules rénales de Rat Kangourou, trois marqueurs fluorescents ont été utilisés.
Identifiez la bonne réponse :

Identifiez la bonne réponse :
A | marqueur vert : pour la kératine ;
marqueur bleu : pour les microtubules ;
marqueur rouge : pour les centromères |
B | marqueur vert : pour les centrosomes ;
marqueur rouge : pour les chromosomes ;
marqueur bleu : pour la kératine |
C | marqueur vert : pour les microtubules ;
marqueur bleu : pour les chromosomes ;
marqueur rouge : pour les centrosomes |
D | marqueur vert : pour la kératine ;
marqueur bleu : pour les chromosomes ;
marqueur rouge : pour les centromères |
E | marqueur vert : pour les microtubules ;
marqueur bleu : pour les chromosomes ;
marqueur rouge : pour les centromères |
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L'expression du génome
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Question 1 |
Le code génétique : parmi les affirmations suivantes, laquelle est erronée :
A | Il est constitué de 64 codons triplets de nucléotides. |
B | Tous les codons désignent un et un seul acide aminé, le code génétique est redondant mais non ambigu. |
C | Il est universel à quelques exceptions près. |
D | Certains acides aminés sont désignés par plusieurs codons. |
E | Sur le tableau du code génétique les codons sont indiqués dans le sens 5' 3' de l'ARNm. |
Explication pour la question 1:
La phrase exacte est :
Trois codons UAG, UGA et UAA ne désignent aucun acide aminé, ce sont les codons STOP ou non sens.
61 codons désignent un acide aminé précis. Le code génétique est redondant mais non ambigu.
Question 2 |
A | Les ribosomes sont des organites présents chez les cellules eucaryotes , les archées et les eubactéries |
B | Les ribosomes sont des particules ribonucléoprotéiques constituées de deux sous-unités |
C | Les ribosomes sont localisés uniquement dans le cytosol |
D | Les ribosomes sont visibles au microscope optique |
E | La photographie présente des polysomes, les protéines fabriquées sont destinées au cytosol |
Explication pour la question 2:
La synthèse des ribosomes (transcription des ARNr, assemblage avec des protéines, maturation) a lieu dans le noyau. Affirmer qu'ils sont uniquement localisés dans le cytosol est donc faux. De plus, il existe des plasto et des mitoribosomes chez les eucaryotes!
Question 3 |
Les étapes de la traduction chez les cellules eucaryotes.
Une de ces affirmations est incorrecte, laquelle ?
A | L'initiation de la traduction débute par la fixation de la petite sous unité du ribosome sur l'extrémité 5' d'un ARNm |
B | La traduction nécessite des facteurs protéiques |
C | Deux types d'ARN, les ARNt et les ARNm, sont nécessaires lors de la phase d'élongation |
D | L'énergie nécessaire à la formation de la liaison peptidique est fournie par la rupture de la liaison ester entre ARNt et chaine polypeptidique en croissance |
E | La chaine polypeptidique est orientée, la séquence en acides aminés commence toujours par l'extrémité NH2 |
Explication pour la question 3:
Il ne faut pas oublier l'ARN ribosomal dont un site a une activité catalytique : le site peptidyltransférase c'est un exemple d'enzyme non protéique.
Question 4 |
La traduction : l'ajout d'un acide aminé sur une chaine polypeptidique en croissance nécessite (une seule réponse correcte) :
A | la rupture d'une liaison phosphoanhydre |
B | la rupture de 2 liaisons phosphoanhydre |
C | la rupture de 3 liaisons phosphoanhydre |
D | la rupture de 4 liaisons phosphoanhydre |
E | Pas d'énergie , c'est une réaction spontanée |
Explication pour la question 4:
- Un ATP est consommé lors de la charge de l'acide aminé sur l'ARNt,
- Un GTP est consommé pour la fixation de l'aminoacyl- ARNt sur le site A,
- Un GTP est consommé pour la translocation du ribosome.
Question 5 |
Collecte et maturation des protéines membranaires et sécrétées :
Les protéines membranaires et les protéines sécrétées (plusieurs bonnes réponses à cocher) :
A | sont fabriquées au niveau du réticulum endoplasmique lisse |
B | sont acheminées dans l'appareil de Golgi |
C | possèdent à leur extrémité N terminale pour la grande majorité une séquence signal |
D | interagissent avec les enzymes du réticulum et de l'appareil de Golgi ce qui permet leur maturation structurale |
E | vont acquérir leur spécificité fonctionnelle dans le lysosome |
Question 6 |

- 5 sous-unités formant les "queues" toutes identiques entre elles,
- 5 sous-unités globulaires formant les "têtes", toutes identiques entre elles.
A | Les différentes sous-unités de la protéine sont fabriquées dans le cytoplasme et s'assemblent dans le noyau |
B | Les têtes sont fabriquées dans le cytoplasme, les queues dans le noyau. L'assemblage des sous-unités a lieu dans le noyau |
C | Les queues sont fabriquées dans le cytoplasme, les têtes dans le noyau. L'assemblage des sous-unités a lieu dans le noyau |
D | Les têtes de nucléoplasmine possèdent une séquence d'importation dans le noyau. L'assemblage des sous unités a lieu dans le cytoplasme |
E | Les queues du nucléoplasmine possèdent une séquence d'importation dans le noyau. L'assemblage des sous-unités a lieu dans le cytoplasme |
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Le phénomène sédimentaire
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Question 1 |
A | Le principal processus responsable de la mise en place de cet affleurement est l’hydrolyse |
B | Cet affleurement est généré par des éboulis et glissements de terrains |
C | Cet affleurement peut aider à la compréhension des conditions climatiques passées |
D | L’eau est l’agent principalement responsable de la genèse de cet affleurement |
E | Un cours d’eau est responsable de l’organisation des éléments rocheux
|
Explication pour la question 1:
Il s'agit d'une moraine latérale témoignant de la présence récente, au regard de la bonne conservation de l'affleurement, d'un glacier.
Question 2 |
L’hydrolyse partielle en climat tropical d’un feldspath sodique, l’albite, de formule NaAlSi3O8, produit un minéral argileux, la kaolinite, de formule Si2O5Al2(OH)4.
Le bilan stœchiométrique de cette réaction permet d’affirmer que :
A | Pour la formation d’1 mole de kaolinite 2 moles d’albite sont nécessaires |
B | Pour la formation d’1 mole de kaolinite 9 moles d’H2O sont nécessaires |
C | Pour la formation d’1 mole de kaolinite 18 moles d’H2O sont nécessaires |
D | Pour la formation d 1 mole de kaolinite 11 moles d’H2O sont nécessaires |
E | Aucune de ces réponses n'est correcte car l’albite est inaltérable |
Explication pour la question 2:
Il s'agit de l'hydrolyse acide d'un feldspath. L'an dernier un exemple de réaction d'hydrolyse a été vu à partir de l'orthose KAlSi3O8. Il suffit de reprendre la méthode appliquée car Na+ se comporte comme K+
Question 3 |
Aidez ce pauvre géologue à classer ces dépôts sédimentaires...
http://www.geolsed.ulg.ac.be/sedim/sedimentologie.htm

A | A : dépôts torrentiels ; B : dépôts glaciaires ; C : dépôts fluviatiles ; D : dépôts de plage |
B | A : dépôts de plage ; B dépôts fluviatiles ; C : dépôts torrentiels ; D : dépôts glaciaires |
C | A : dépôts fluviatiles ; B : dépôts de plage ; C : dépôts glaciaires ; D : dépôts torrentiels |
D | A : dépôts glaciaires ; B : dépôts torrentiels ; C : dépôts fluviatiles ; D : dépôts de plage |
E | A : dépôts glaciaires ; B : dépôts torrentiels ; C : dépôts de plage ; D : dépôts fluviatiles |
Explication pour la question 3:
Les dépôts glaciaires sont très hétérogènes ; seuls les plus gros éléments se déposent dans les torrents ; les dépôts de plage (ici des galets) sont usés par le transport fluviatile, la houle...
Question 4 |
L’analyse des 2 lames minces de roches carbonatées présentées ci-dessous permet de déduire :
http://www.geolsed.ulg.ac.be/sedim/sedimentologie.htm

A | Que le milieu de dépôt était agité |
B | Qu’il s’agit d’un mudstone |
C | Qu’il s’agit d’un packstone |
D | Qu’il y avait des organismes dans le milieu de dépôt |
E | Qu’il s’agit d’un milieu de dépôt lacustre |
Explication pour la question 4:
La matrice micritique est prépondérante, elle résulte de la bioprécipitation d'organismes dans des milieux calmes et de fortes profondeurs mais au dessus de la CCD (boue calcaire des grands fonds).
Question 5 |
A | L’échelle verticale est en km |
B | Les traits sombres représentent des réflecteurs sismiques |
C | La côte est à l’ouest et le large à l’est |
D | Des figures de progradation (downlap) sont visibles |
E | Des failles normales sont visibles |
Question 6 |
Le cliché ci-dessous représente une lame mince de roche carbonatée.
La lettre q désigne les cristaux de quartz et la lettre c de la silice amorphe : la calcédoine.
La présence de quartz et de calcédoine dans cette roche carbonatée s’explique par :
http://www.geolsed.ulg.ac.be/sedim/sedimentologie.html

A | Le phénomène de compaction liée à la diagenèse |
B | La présence de quartz dans le milieu de dépôt |
C | La présence de minéraux argileux dans le milieu de dépôt |
D | La présence de pores dans la roche |
E | Un processus de silicification diagénétique |
Explication pour la question 6:
Il s'agit d'un phénomène de remplacement lié à l'évolution de la composition chimique du substrat au cours de la diagenèse. Les cavités ultimes de la roche carbonatée sont remplies par des fluides sursaturés en silice qui précipitent formant quartz et calcédoine.
La silicification fait partie de la diagenèse tardive.
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Les poissons, crocodiles et tortues fossiles du bassin lacustre éocène inférieur de la Green River, Wyoming (États-Unis d’Amérique) (source : Planet-Terre)
Cet « échantillon » est présenté au Musée des Confluences

Dalle à fossiles de Knightia eocaena, poissons téléostéens lacustres, prélevée dans le bassin de la Green River (Wyoming, États-Unis d’Amérique), bassin sédimentaire de l’Éocène inférieur